สำนักงานศุลกากรภาคที่ 1 มีเขตรับผิดชอบในพื้นที่ภาคตะวันออก ภาคตะวันตก ภาคใต้ตอนบนและภาคใต้ฝั่งทะเลอันดามัน รวม 13 จังหวัด คือ จังหวัด กาญจนบุรี สระแก้ว ชลบุรี ระยอง จันทบุรี ตราด สมุทรสงคราม ราชบุรี เพชรบุรี ประจวบคีรีขันธ์ ชุมพร ระนอง และสุราษฎร์ธานี โดยมีด่านศุลกากร หรือหน่วยงาน ในสังกัด รวม 11 หน่วยงาน ดังนี้