ประวัติความเป็นมา
ด่านศุลกากรจันทบุรี เป็นด่านศุลกากรทางทะเลด้านอ่าวไทย ในอดีตเป็น
ด่านเก็บภาษี ขึ้นอยู่กับมณฑลจันทบุรี สังกัดกรมสรรพากร
กระทรวงพระคลังมหาสมบัติ จนกระทั่งเมื่อวันที่ 1 เมษายน 2463ได้มีการโอนด่านเก็บภาษีในมณฑลจันทบุรีทั้งหมดจากกรมสรรพากรมาขึ้นอยู่กับกรมศุลกากร
ตั้งแต่นั้นมา ด่านเก็บภาษีจันทบุรี จึงสังกัดกรมศุลกากร ต่อมาได้ตั้งขึ้นเป็น
ด่านศุลกากรจันทบุรี ตามกฎกระทรวงพระคลังมหาสมบัติลงวันที่ 3
กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2474 โดยเป็นด่านฝากอำเภอเมืองจันทบุรี ซึ่งมีนายอำเภอเมืองจันทบุรีทำหน้าที่นายด่านศุลกากรโดยตำแหน่ง
ภายหลังได้มีกฎกระทรวงการคลัง ลงวันที่ 21 ตุลาคม 2481 ตั้งขึ้นเป็น
ด่านศุลกากรท่าแฉลบ แต่ก็ยังคงฝากอำเภอเมืองจันทบุรี จนกระทั่งปี พ.ศ.
2493 กรมศุลกากรได้สร้างที่ทำการด่านศุลกากรท่าแฉลบขึ้นเป็นอาคารไม้ชั้นเดียว
ปลูกยื่นลงไปในน้ำริมคลองท่าแฉลบ พร้อมกับตั้งเจ้าหน้าที่ศุลกากรไปปฏิบัติหน้าที่นายด่านศุลกากรท่าแฉลบ
ต่อมาที่ทำการชำรุด ทรุดโทรมมาก กรมศุลกากรจึงได้ย้ายมาสร้างใหม่บนชายฝั่งที่ตำบลบางกะจะ
อำเภอเมือง จังหวัดจันทบุรีและยังคงอยู่จนถึงปัจจุบัน แต่มีสภาพชำรุดทรุดโทรมเช่นกัน
